AmigaOS är det egna ursprungliga operativsystemet för Amiga och AmigaOne persondatorer, introducerat med lanseringen av den första Amiga, Amiga 1000, 1985. Den senaste versionen är AmigaOS 4.1, utvecklad av Hyperion Entertainment, som fick 2009 av AmigaInc. en exklusiv, evig, världsomspännande licens till AmigaOS 3.1 för att utveckla och marknadsföra AmigaOS 4 och efterföljande versioner.AmigaOS är ett operativsystem för en användare baserat på en preemptiv multitasking-kärna, kallad Exec.Det inkluderar en abstraktion av Amigas hårdvara, ett skivoperativsystem som heter AmigaDOS, ett fönsterfönster-API som heter Intuition och en stationär filhanterare som heter Workbench.Ett kommandoradsgränssnitt, kallad AmigaShell, är också integrerat i systemet, även om det också är helt fönsterbaserat.CLI- och Workbench-komponenterna har samma privilegier.Särskilt saknar AmigaOS något inbyggt minneskydd.AmigaOS består av två delar: en firmware-komponent som kallas Kickstart och en mjukvarudel som vanligtvis kallas Workbench.Fram till AmigaOS 3.1 släpptes vanligtvis matchande versioner av Kickstart och Workbench tillsammans.Sedan AmigaOS 3.5, den första utgåvan efter Commodores bortgång, har emellertid endast mjukvarukomponenten uppdaterats och Kickstarts roll har minskat något.Firmware-uppdateringar kan fortfarande tillämpas genom att lappa vid systemstarten.2006 skrivdes AmigaOS 4.0 om för att bli fullt PowerPC-kompatibelt.Skärmarna blev dragbara i valfri riktning, drag och släpp av arbetsbänkikoner mellan olika skärmar var möjlig, ny version av Amidock, TrueType / OpenType-teckensnitt och filmspelare med DivX och MPEG-4-stöd lades till.I AmigaOS 4.1 lades en ny startinställningsfunktion som ersatte WBStartup-lådan.Ytterligare förbättringar var en ny ikonuppsättning för att komplettera högre skärmupplösningar, nya fönster teman inklusive drop skuggor, AmiDock med sann transparens, skalbara ikoner och AmigaOS med auto-uppdatering funktion.