BioBlender är ett mjukvarupaket som är byggt på den öppna källkodsprogramvaran för 3D-modellering.Biologi fungerar på nanoskala, med föremål som är osynliga för det mänskliga ögat.Med BioBlender är det möjligt att visa några av de karaktärer som fyller våra celler, baserat på vetenskaplig data och den högsta standarden för 3D-manipulation.Forskare över hela världen studerar proteiner på atomnivå och deponerar information i det offentliga förvaret Protein Data Bank, där varje molekyl beskrivs som listan över dess atomer och deras 3D-koordinater .... Med BioBlender kan användare hantera proteiner i 3D-utrymmet, visa deras yta på ett fotorealistiskt sätt, och utarbeta proteinrörelser på basis av kända konformationer.PDB-filer kan laddas från en användardefinierad katalog eller laddas ner direkt från PDB-webbplatsen (genom att infoga PDB-koden).Proteinet visas i 3D (som atomer eller molekylär yta) och användaren kan beräkna och visualisera dess ytegenskaper, Molecular Lipophilic Potential and Electrostatic Potential.För proteinrörelse beräknar BioBlender mellanprodukter mellan två konformationer med Blender Game Engine.Programmet ger som utgång både mellanliggande PDB-filer och de återgivna bilderna som en film.BioBlender är en implementering av Blender, en öppen källa, fritt distribuerad, multiplatform, interoperabelt och stött program av 3D-animering, visuella effekter och videospel.Kombinationen av 3D-datorgrafik, spelmotor och vetenskapliga program gör av BioBlender till ett komplett instrument för att utarbeta rörelsen av proteiner och för att visa deras ytfunktioner med hjälp av en visuell kod baserad på texturering och partiklarnas specialeffekter.På detta sätt är det möjligt att visa de fysikaliska och kemiska egenskaperna hos en molekyl i rörelse.BioBlender är resultatet av ett samarbete, drivet av SciVis-gruppen vid CNR i Pisa (Italien), mellan forskare från olika discipliner (biologi, kemi, fysik, datavetenskap) och