DNAssist

DNAssist

DNAssist tillhandahåller ett intuitivt, enda gränssnitt inom vilket sekvensfiler visas, redigeras och analyseras.Användaren kan anpassa skärmen i redigeringsfönstren genom att välja teckensnitt, teckenstorlek och linjelängd.En sekvens analyseras genom att helt enkelt föra ett redigeringsfönster upp till toppen och välja önskad analys från menyn.Alla analyser kan också utföras på en vald region i sekvensen i ett redigeringsfönster.Högerklicka med musen ger en kontextkänslig popup-meny.Detta ger användaren en bekväm genväg till de flesta menyalternativ.Analyserna tillgängliga på DNAssist inkluderar: Omvandlingen av en DNA-sekvens mellan de cirkulära och linjära formerna Konvertering av DNA till ett RNA eller en proteinsekvens Konvertering av RNA till ett DNA eller en proteinsekvens Översättning av en DNA-sekvens till aminosyrasekvenseni en, tre eller alla sex ramar Lokalisering av öppna läsramar (ORF) i en DNA-sekvens Lokalisering av specifika sekvensmönster i en sekvens (detta tillåter jokertecken, missanpassningar och luckor) Utför en restriktionsenzymanalys med en definierad uppsättning enzymer Utföra en DNA-promotoranalys med specificerade transkriptionsfaktorer Lokalisering av starka nukleosompositioneringssignaler i DNA Utförande av flera anpassningar av DNA, RNA eller proteiner Att erhålla molekylvikten för en nukleinsyra eller protein Erhålla smälttemperaturen för en oligonukleotid Beräkna pI för ett protein Beräkna den hydrofila, hydrofoba ellerantigenprofil för ett protein Uppnå den molära absorptionskoefficienten och E0,1% av en nukleinsyrad eller ett protein Att få nukleotid- eller aminosyrasammansättningen för en nukleinsyra eller protein-DNAssist förenar alla dessa funktioner i en tätt integrerad Windows-applikation.Resultatet av en analys visas i ett resultatfönster och kan skrivas ut, sparas på disken eller kopieras och klistras in i tredjepartsapplikationer.Sparade eller kopierade resultat behåller formatet där de visades ....
dnassist

kategorier

Alternativ till DNAssist för Linux