123
VMD - Visual Molecular Dynamics

VMD - Visual Molecular Dynamics

VMD kan arbeta med mycket stora strukturer upp till gränserna för tillgängligt minne.64-bitarsversionerna av VMD gör det möjligt att ladda simuleringsbanor med stor storlek och lång tid i fysiskt minne och rymma stora volymetriska datasätt.Den 64 miljoner atom-HIV-kapsidsimuleringen som beskrivs i den 30 maj 2013-numret av Nature är ett förstklassigt exempel på vad som kan göras med VMD på en lämpligt utrustad grafikarbetsstation.HIV-1-modellen förbereddes för simulering med användning av strukturbyggnadsverktyg och skriptfunktioner hos VMD användes senare för bananalys.Helatomstrukturen för HIV-1-kapsiden visad på Nature-locket gjordes inom VMD med användning av den inre Tachyon-strålspårningsmotorn och komponerades sedan med en konstnärlig representation av det virala höljet och Nature-omslagstexten....

kategorier

Alternativ till VMD - Visual Molecular Dynamics för Windows

Jmol

Jmol

Jmol är en fri open source-molekylvisare för studenter, lärare och forskare inom kemi och biokemi.
Rasmol

Rasmol

RasMol är ett datorprogram skrivet för visualisering av molekylär grafik avsedd och används främst för avbildning och utforskning av biologiska makromolekylstrukturer ...
pymol

pymol

PyMOL är en kraftfull och omfattande molekylär visualiseringsprodukt för rendering och animering av 3D-molekylstrukturer.